RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PKP3-201ENST00000331563 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.27■■□□□ 1.16
PKP3-201ENST00000331563 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PKP3-201ENST00000331563 C3P01024 1663 aa22.27■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 SHPRHQ149N8 1683 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 NUCB2P80303 420 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 CCDC27Q2M243 656 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 EID1Q9Y6B2 187 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 KIF16BQ96L93 1317 aa22.26■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 MCM5P33992 734 aa22.25■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 RNF214Q8ND24 703 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 NSD2O96028 1365 aa22.24■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.23■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 SOX12O15370 315 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 SYCE3A1L190 88 aa22.22■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 USP32Q8NFA0 1604 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 AK9Q5TCS8 1911 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 PKP1Q13835 747 aa22.21■■□□□ 1.15
PKP3-201ENST00000331563 DLC1Q96QB1 1528 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 POLKQ9UBT6 870 aa22.2■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 PTPRUQ92729 1446 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 HMOX1P09601 288 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.19■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 CBX1P83916 185 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 GPT2Q8TD30 523 aa22.18■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 LRSAM1Q6UWE0 723 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 VGLL3A8MV65 326 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 TSC1Q92574 1164 aa22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 TAF3Q5VWG9 929 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 RABEP1Q15276 862 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 MPNDQ8N594 471 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 CDC45O75419 566 aa22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.15■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.14■■□□□ 1.14
PKP3-201ENST00000331563 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.14■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 ACEP12821 1306 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 CPS1P31327 1500 aa22.13■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 GCC1Q96CN9 775 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 COG3Q96JB2 828 aa22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 KCNA6P17658 529 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 TECPR2O15040 1411 aa22.11■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 ATP7BP35670 1465 aa22.1■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 FAM177BA6PVY3 158 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 PRKAR2BP31323 418 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 SIRT1Q96EB6 747 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.09■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 ST18O60284 1047 aa22.08■■□□□ 1.13
PKP3-201ENST00000331563 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 TBX22Q9Y458 520 aa22.07■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 ATP2B3Q16720 1220 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 TSPY26PQ9H489 355 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.06■■□□□ 1.12
PKP3-201ENST00000331563 MBD3O95983 291 aa22.04■■□□□ 1.12
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