RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 PTMSP20962 102 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 USP6P35125 1406 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 GBP4Q96PP9 640 aa28.02■■■□□ 2.08
HOXD1-201ENST00000331462 TTC22Q5TAA0 569 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.01■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 MRE11P49959 708 aa28■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 CRB1P82279 1406 aa28■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 SSH2Q76I76 1423 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 RTL1A6NKG5 1358 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF10O15013 1369 aa27.98■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 CEP85Q6P2H3 762 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 CLEC17AQ6ZS10 378 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 ACEP12821 1306 aa27.97■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 MSH6P52701 1360 aa27.96■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
HOXD1-201ENST00000331462 RABEP1Q15276 862 aa27.95■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.94■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 KRT24Q2M2I5 525 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 MCM10Q7L590 875 aa27.91■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 KDRP35968 1356 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 PANK2Q9BZ23 570 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.9■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 USP26Q9BXU7 913 aa27.89■■■□□ 2.06
HOXD1-201ENST00000331462 MEIS3Q99687 375 aa27.87■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC37A3O60309 1634 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 SBNO1A3KN83 1393 aa27.86■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 FLT4P35916 1363 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 PTPRUQ92729 1446 aa27.85■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 SDSP20132 328 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 CASC1Q6TDU7 716 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 HMMRO75330 724 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 OSBPL3Q9H4L5 887 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXD1-201ENST00000331462 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 ARXQ96QS3 562 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 SLC4A2P04920 1241 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 SSFA2P28290 1259 aa27.82■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA6L22H0YM25 854 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 IGSF1Q8N6C5 1336 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 LTKP29376 864 aa27.8■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 REC8O95072 547 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 NUCB2P80303 420 aa27.79■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 SLIT1O75093 1534 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 BAG4O95429 457 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 CLCN1P35523 988 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 DIP2AQ14689 1571 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 KLHL40Q2TBA0 621 aa27.77■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3C2AO00443 1686 aa27.76■■■□□ 2.04
HOXD1-201ENST00000331462 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.76■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 USP54Q70EL1 1684 aa27.75■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 ERC2O15083 957 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 FOXO3O43524 673 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 ST18O60284 1047 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 G2E3Q7L622 706 aa27.74■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 SALL3Q9BXA9 1300 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 PDE1AP54750 535 aa27.73■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 NUTM2FA1L443 756 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 GNAI2P04899 355 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 EYA1Q99502 592 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.71■■■□□ 2.03
HOXD1-201ENST00000331462 TBX22Q9Y458 520 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD1-201ENST00000331462 NWD1Q149M9 1564 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD1-201ENST00000331462 CACNA1FO60840 1977 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD1-201ENST00000331462 F6X3S4 739 aa27.69■■■□□ 2.02
HOXD1-201ENST00000331462 STK31Q9BXU1 1019 aa27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms