RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 SMC5Q8IY18 1101 aa28.96■■■□□ 2.23
SNX18-201ENST00000326277 RTL1A6NKG5 1358 aa28.96■■■□□ 2.23
SNX18-201ENST00000326277 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
SNX18-201ENST00000326277 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
SNX18-201ENST00000326277 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 LTN1O94822 1766 aa28.95■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 MIS18AQ9NYP9 233 aa28.93■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 NFAT5O94916 1531 aa28.93■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 ORAI2Q96SN7 254 aa28.92■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 IP6K1Q92551 441 aa28.9■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 TSPYL4Q9UJ04 414 aa28.9■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 SEC24BO95487 1268 aa28.89■■■□□ 2.22
SNX18-201ENST00000326277 C1orf115Q9H7X2 142 aa28.89■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.87■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.87■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 USP19O94966 1318 aa28.87■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.86■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 LRRC37A3O60309 1634 aa28.86■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 RGS12O14924 1447 aa28.85■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 NUCB1Q02818 461 aa28.84■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K5Q99683 1374 aa28.83■■■□□ 2.21
SNX18-201ENST00000326277 MSH6P52701 1360 aa28.82■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.82■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 PTPRCP08575 1304 aa28.81■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.81■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.81■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 IL17REQ8NFR9 667 aa28.81■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 NBPF4Q96M43 638 aa28.81■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 SLC4A2P04920 1241 aa28.8■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.79■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.79■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 GCP02774 474 aa28.78■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 GCC1Q96CN9 775 aa28.78■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 LNPKQ9C0E8 428 aa28.78■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.78■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 NBR1Q14596 966 aa28.78■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 SLIT3O75094 1523 aa28.77■■■□□ 2.2
SNX18-201ENST00000326277 SLC4A3P48751 1232 aa28.76■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.76■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHG5O94827 1062 aa28.76■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.75■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.75■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 KIF1AQ12756 1690 aa28.74■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.73■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 G2E3Q7L622 706 aa28.73■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.73■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.71■■■□□ 2.19
SNX18-201ENST00000326277 STK31Q9BXU1 1019 aa28.69■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 TMEM94Q12767 1356 aa28.69■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.68■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.68■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 ATP10DQ9P241 1426 aa28.68■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.67■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.67■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 MST1RQ04912 1400 aa28.66■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 F6X3S4 739 aa28.66■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 ATF3P18847 181 aa28.66■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 MEIS3Q99687 375 aa28.66■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.65■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.65■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 LGR6Q9HBX8 967 aa28.64■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 NCAPD2Q15021 1401 aa28.64■■■□□ 2.18
SNX18-201ENST00000326277 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.63■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 NECTIN2Q92692 538 aa28.63■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 DCTPP1Q9H773 170 aa28.63■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.63■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 CEP85Q6P2H3 762 aa28.63■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 ALS2Q96Q42 1657 aa28.62■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 FLIIQ13045 1269 aa28.62■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 DCCP43146 1447 aa28.61■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.61■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.6■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.6■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.59■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 HSPA2P54652 639 aa28.58■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.58■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
SNX18-201ENST00000326277 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.57■■■□□ 2.16
SNX18-201ENST00000326277 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
SNX18-201ENST00000326277 PXDNQ92626 1479 aa28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms