RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.27■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.26■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 TMEM94Q12767 1356 aa16.26■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 IP6K1Q92551 441 aa16.26■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 LRRC7Q96NW7 1537 aa16.25■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.25■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 BTBD11A6QL63 1104 aa16.25■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 CCDC30Q5VVM6 783 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 LGR6Q9HBX8 967 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 SLIT1O75093 1534 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa16.24■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 MED14O60244 1454 aa16.23■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 G2E3Q7L622 706 aa16.23■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 TATP17735 454 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 MSH6P52701 1360 aa16.22■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 CHL1O00533 1208 aa16.21■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 MYT1Q01538 1121 aa16.21■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 PIK3R4Q99570 1358 aa16.21■□□□□ 0.19
HPS1-201ENST00000325103 DIP2AQ14689 1571 aa16.2■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 PTCH1Q13635 1447 aa16.2■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 IL17REQ8NFR9 667 aa16.2■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 AAMPQ13685 434 aa16.2■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 IQSEC2Q5JU85 1478 aa16.2■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 MYL6BP14649 208 aa16.19■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 SLC39A6Q13433 755 aa16.19■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.19■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 MEIS3Q99687 375 aa16.19■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa16.19■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.19■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 HMMRO75330 724 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 KCNQ3O43525 872 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 FLIIQ13045 1269 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 BECN1Q14457 450 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 OVOS2Q6IE36 1432 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 AXIN2Q9Y2T1 843 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 IGSF1Q8N6C5 1336 aa16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 CHD1LQ86WJ1 897 aa16.17■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 SHPRHQ149N8 1683 aa16.16■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 ZNF853P0CG23 659 aa16.16■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 PIP4K2BP78356 416 aa16.16■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa16.16■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 ARHGEF10O15013 1369 aa16.16■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 MAP3K5Q99683 1374 aa16.16■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 USP32Q8NFA0 1604 aa16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 SEC24BO95487 1268 aa16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 C8orf34Q49A92 452 aa16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 KIF20BQ96Q89 1820 aa16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.15■□□□□ 0.18
HPS1-201ENST00000325103 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 ARHGEF25Q86VW2 580 aa16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 CHPF2Q9P2E5 772 aa16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 SPG7Q9UQ90 795 aa16.14■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 ITSN1Q15811 1721 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 USP31Q70CQ4 1352 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 SLAIN2Q9P270 581 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.13■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 CABP4P57796 275 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 GNAI2P04899 355 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 RIC3Q7Z5B4 369 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 CCT4P50991 539 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 RILPL2Q969X0 211 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.12■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 AKAP4Q5JQC9 854 aa16.11■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 GCC1Q96CN9 775 aa16.11■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 PI4KAP2A4QPH2 592 aa16.11■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 ADAMTS2O95450 1211 aa16.11■□□□□ 0.17
HPS1-201ENST00000325103 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms