RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317370.12

SLC2A4-201, Transcript of solute carrier family 2 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC2A4, Length 3,426 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC2A4-201ENST00000317370 PDCL3Q9H2J4 239 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC2A4-201ENST00000317370 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC2A4-201ENST00000317370 FAM13BQ9NYF5 915 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC2A4-201ENST00000317370 IGHDP01880 384 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC2A4-201ENST00000317370 MRE11P49959 708 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC2A4-201ENST00000317370 ARHGEF25Q86VW2 580 aa14.77□□□□□ -0.04
SLC2A4-201ENST00000317370 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
SLC2A4-201ENST00000317370 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 TEFQ10587 303 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 ANXA1P04083 346 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 LGR6Q9HBX8 967 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 IP6K1Q92551 441 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 BCAR3O75815 825 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 SMIM5Q71RC9 77 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 STRCQ7RTU9 1775 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 TECPR2O15040 1411 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 RUNDC1Q96C34 613 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 IL13P35225 146 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 AFF2P51816 1311 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 TPM2P07951 284 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 FAM177BA6PVY3 158 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC2A4-201ENST00000317370 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 EXOC5O00471 708 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 TSPYL4Q9UJ04 414 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 COG6Q9Y2V7 657 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 GOLGA2Q08379 1002 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 AAMPQ13685 434 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 PRDM4Q9UKN5 801 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 IFT172Q9UG01 1749 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 KCNQ3O43525 872 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 DDB1Q16531 1140 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 FLT4P35916 1363 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 PANK1Q8TE04 598 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 ERBB3P21860 1342 aa14.68□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 MYL6BP14649 208 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 KCNQ2O43526 872 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.67□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 CABP4P57796 275 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 WWC1Q8IX03 1113 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.66□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 STRCP1A6NGW2 1772 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 ARHGEF10O15013 1369 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 IL2RBP14784 551 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 FOXD4L1Q9NU39 408 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 FCHSD2O94868 740 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.65□□□□□ -0.06
SLC2A4-201ENST00000317370 APBB1O00213 710 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 KLHL34Q8N239 644 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 NALCNQ8IZF0 1738 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 BTBD11A6QL63 1104 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 TRIM37O94972 964 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 TSPYL6Q8N831 410 aa14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 NFE2L2Q16236 605 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 SBNO1A3KN83 1393 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 LAMC1P11047 1609 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 DLC1Q96QB1 1528 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 PHF14O94880 888 aa14.62□□□□□ -0.07
SLC2A4-201ENST00000317370 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms