RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLFN5Q08AF3 891 aa22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 POTEAQ6S8J7 498 aa22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20-201ENST00000316412 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 E9PSI1 815 aa22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAP3K5Q99683 1374 aa22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 IL16Q14005 1332 aa22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 C8orf37Q96NL8 207 aa22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRRC37A3O60309 1634 aa22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 SOCS7O14512 581 aa22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 DCTN1Q14203 1278 aa22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 NGLY1Q96IV0 654 aa22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 DISP2A7MBM2 1401 aa22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 IL2RBP14784 551 aa22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 MCM10Q7L590 875 aa22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP35Q9P2H5 1018 aa22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPG7Q9UQ90 795 aa22.64■■□□□ 1.22
PRAMEF20-201ENST00000316412 AFF2P51816 1311 aa22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 IL17REQ8NFR9 667 aa22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF853P0CG23 659 aa22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFT57Q9NWB7 429 aa22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 CYP27B1O15528 508 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHKG2P15735 406 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 VPS72Q15906 364 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 USP21Q9UK80 565 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 CFAP44Q96MT7 982 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 LGR6Q9HBX8 967 aa22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20-201ENST00000316412 GNAI1P63096 354 aa22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHL1O00533 1208 aa22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 BARGINQ6ZT62 677 aa22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 MBIPQ9NS73 344 aa22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 GLI3P10071 1580 aa22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATRNO75882 1429 aa22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNS2Q63HR2 1409 aa22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF20-201ENST00000316412 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.51■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 RXRBP28702 533 aa22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 DCAF5Q96JK2 942 aa22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MRC1P22897 1456 aa22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.5■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 EXOC5O00471 708 aa22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PRAMEF20-201ENST00000316412 TEFQ10587 303 aa22.47■■□□□ 1.19
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