RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.54■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 FAM161AQ3B820 660 aa23.53■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.52■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA0232Q92628 1395 aa23.52■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 DCTN1Q14203 1278 aa23.52■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 TSPYL6Q8N831 410 aa23.52■■□□□ 1.36
HCLS1-201ENST00000314583 CHL1O00533 1208 aa23.51■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.51■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC37A3O60309 1634 aa23.51■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 RGS3P49796 1198 aa23.5■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 CRB1P82279 1406 aa23.5■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 GCP02774 474 aa23.5■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.5■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.49■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.49■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.49■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 PXDNQ92626 1479 aa23.48■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 MCM10Q7L590 875 aa23.47■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.47■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.46■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 NCAPD2Q15021 1401 aa23.46■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.45■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.45■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
HCLS1-201ENST00000314583 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.45■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 C8orf34Q49A92 452 aa23.45■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC4O15439 1325 aa23.45■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.44■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.43■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.41■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 NBPF4Q96M43 638 aa23.41■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 MAP3K5Q99683 1374 aa23.39■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.39■■□□□ 1.34
HCLS1-201ENST00000314583 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.39■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 BRINP3Q76B58 766 aa23.38■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.38■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 COL18A1P39060 1754 aa23.38■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 RGPD5Q99666 1765 aa23.38■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.38■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 ABCC6O95255 1503 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
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HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.36■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 PTPRCP08575 1304 aa23.36■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.35■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.34■■□□□ 1.33
HCLS1-201ENST00000314583 PLEKHG5O94827 1062 aa23.33■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 MYT1Q01538 1121 aa23.33■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 CACNA1FO60840 1977 aa23.32■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 KRT24Q2M2I5 525 aa23.32■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 SLAIN2Q9P270 581 aa23.32■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 RGS12O14924 1447 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 IL17REQ8NFR9 667 aa23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 ERBB3P21860 1342 aa23.3■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.29■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 CPDO75976 1380 aa23.29■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.28■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 GCC1Q96CN9 775 aa23.28■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.27■■□□□ 1.32
HCLS1-201ENST00000314583 NUCB1Q02818 461 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 ABCA3Q99758 1704 aa23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.25■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.24■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.24■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 SLC4A2P04920 1241 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 STK31Q9BXU1 1019 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.22■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HCLS1-201ENST00000314583 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.21■■□□□ 1.31
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