RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 USP35Q9P2H5 1018 aa29.02■■■□□ 2.24
CTU2-201ENST00000312060 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.02■■■□□ 2.24
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CTU2-201ENST00000312060 MEGF6O75095 1541 aa29.01■■■□□ 2.24
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CTU2-201ENST00000312060 WDR63Q8IWG1 891 aa29■■■□□ 2.23
CTU2-201ENST00000312060 CDCA7LQ96GN5 454 aa29■■■□□ 2.23
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CTU2-201ENST00000312060 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.97■■■□□ 2.23
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CTU2-201ENST00000312060 USP21Q9UK80 565 aa28.95■■■□□ 2.22
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CTU2-201ENST00000312060 DCTN1Q14203 1278 aa28.94■■■□□ 2.22
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CTU2-201ENST00000312060 E9PSI1 815 aa28.93■■■□□ 2.22
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CTU2-201ENST00000312060 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.93■■■□□ 2.22
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CTU2-201ENST00000312060 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.93■■■□□ 2.22
CTU2-201ENST00000312060 MCM10Q7L590 875 aa28.92■■■□□ 2.22
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CTU2-201ENST00000312060 VPS72Q15906 364 aa28.91■■■□□ 2.22
CTU2-201ENST00000312060 AFF2P51816 1311 aa28.9■■■□□ 2.22
CTU2-201ENST00000312060 IL16Q14005 1332 aa28.9■■■□□ 2.22
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CTU2-201ENST00000312060 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.87■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 IL17REQ8NFR9 667 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 PHKG2P15735 406 aa28.86■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
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CTU2-201ENST00000312060 LGR6Q9HBX8 967 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 IFT57Q9NWB7 429 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.83■■■□□ 2.21
CTU2-201ENST00000312060 GNAI1P63096 354 aa28.82■■■□□ 2.2
CTU2-201ENST00000312060 LRRC37A3O60309 1634 aa28.81■■■□□ 2.2
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CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.79■■■□□ 2.2
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CTU2-201ENST00000312060 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
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CTU2-201ENST00000312060 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.7■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 A0A0G2JS52 829 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 MYT1Q01538 1121 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.68■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.67■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.67■■■□□ 2.18
CTU2-201ENST00000312060 BTBD11A6QL63 1104 aa28.65■■■□□ 2.18
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