RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 RABEP1Q15276 862 aa10.5□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.5□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 TSPYL6Q8N831 410 aa10.5□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF853P0CG23 659 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PRKAR2BP31323 418 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 TECPR2O15040 1411 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 TERF1P54274 439 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 HS1BP3Q53T59 392 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PDLIM2Q96JY6 352 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 TBX22Q9Y458 520 aa10.49□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 CPS1P31327 1500 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 NUCB2P80303 420 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 NFE2L2Q16236 605 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PDCL3Q9H2J4 239 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP10DQ9P241 1426 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 TTC22Q5TAA0 569 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 WAPLQ7Z5K2 1190 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PHACTR3Q96KR7 559 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 USP26Q9BXU7 913 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 IFT57Q9NWB7 429 aa10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PKP1Q13835 747 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 MCTP1Q6DN14 999 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 CFAP44Q96MT7 982 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 DCTPP1Q9H773 170 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 MBIPQ9NS73 344 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 POLKQ9UBT6 870 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 PTPRUQ92729 1446 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP7BP35670 1465 aa10.47□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 GNAI1P63096 354 aa10.46□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 RBSNQ9H1K0 784 aa10.46□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
UBQLN3-201ENST00000311659 RGS12O14924 1447 aa10.46□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 MSNP26038 577 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 SIRT1Q96EB6 747 aa10.46□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ROBO2Q9HCK4 1378 aa10.46□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 GPT2Q8TD30 523 aa10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ZDHHC9Q9Y397 364 aa10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.44□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 HMOX1P09601 288 aa10.44□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 FBLN1P23142 703 aa10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 IL13P35225 146 aa10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 CABP1Q9NZU7 370 aa10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 NRKQ7Z2Y5 1582 aa10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 MON2Q7Z3U7 1717 aa10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 CDK19Q9BWU1 502 aa10.43□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 SDSP20132 328 aa10.42□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNA6P17658 529 aa10.42□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 HSPA2P54652 639 aa10.42□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.42□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ST18O60284 1047 aa10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 LRSAM1Q6UWE0 723 aa10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 NCLP19338 710 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 MCM5P33992 734 aa10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 CEP85Q6P2H3 762 aa10.41□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 AKAP12Q02952 1782 aa10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 RTL1A6NKG5 1358 aa10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 AATKQ6ZMQ8 1374 aa10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 MSH6P52701 1360 aa10.4□□□□□ -0.74
UBQLN3-201ENST00000311659 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms