RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 NFKBIBQ15653 356 aa27.17■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.17■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 NWD1Q149M9 1564 aa27.17■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 KRT24Q2M2I5 525 aa27.17■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 CHL1O00533 1208 aa27.16■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 ORAI2Q96SN7 254 aa27.16■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 LTN1O94822 1766 aa27.16■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.16■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.15■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 CRB1P82279 1406 aa27.14■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.13■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.13■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.12■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 RTL1A6NKG5 1358 aa27.12■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHG5O94827 1062 aa27.12■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 NFAT5O94916 1531 aa27.11■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.1■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 ABCC4O15439 1325 aa27.09■■□□□ 1.93
MESP1-201ENST00000300057 KIAA0232Q92628 1395 aa27.08■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.07■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 IP6K1Q92551 441 aa27.07■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.07■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.07■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.06■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.04■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.04■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.01■■□□□ 1.92
MESP1-201ENST00000300057 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.01■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 SMC5Q8IY18 1101 aa27.01■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 MAP3K5Q99683 1374 aa27.01■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 LRRC37A3O60309 1634 aa27■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 NBPF6Q5VWK0 638 aa27■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 NBPF4Q96M43 638 aa27■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 GCP02774 474 aa26.99■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.99■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 MSH6P52701 1360 aa26.99■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 KIF1AQ12756 1690 aa26.97■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.96■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 SLIT3O75094 1523 aa26.96■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 RGS12O14924 1447 aa26.96■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 TMEM94Q12767 1356 aa26.96■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 IL17REQ8NFR9 667 aa26.96■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 SEC24BO95487 1268 aa26.95■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 SLC4A2P04920 1241 aa26.95■■□□□ 1.91
MESP1-201ENST00000300057 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.95■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 ATF3P18847 181 aa26.94■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 HSPA2P54652 639 aa26.94■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.94■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 PTPRCP08575 1304 aa26.93■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 NUCB1Q02818 461 aa26.92■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 USP19O94966 1318 aa26.91■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 LNPKQ9C0E8 428 aa26.91■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 MST1RQ04912 1400 aa26.9■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.9■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 SLC4A3P48751 1232 aa26.9■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 G2E3Q7L622 706 aa26.89■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
MESP1-201ENST00000300057 CHD1LQ86WJ1 897 aa26.88■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.87■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 NECTIN2Q92692 538 aa26.87■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 GCC1Q96CN9 775 aa26.87■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 STK31Q9BXU1 1019 aa26.86■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD45Q5TZF3 282 aa26.86■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.85■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 ALS2Q96Q42 1657 aa26.85■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 F6X3S4 739 aa26.84■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 LGR6Q9HBX8 967 aa26.84■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 DCCP43146 1447 aa26.84■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.83■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.83■■□□□ 1.89
MESP1-201ENST00000300057 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.83■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.83■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 MEIS3Q99687 375 aa26.81■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 RGPD5Q99666 1765 aa26.8■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa26.79■■□□□ 1.88
MESP1-201ENST00000300057 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms