RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
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TRIM54-201ENST00000296098 KRT24Q2M2I5 525 aa30.2■■■□□ 2.43
TRIM54-201ENST00000296098 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.2■■■□□ 2.43
TRIM54-201ENST00000296098 NWD1Q149M9 1564 aa30.2■■■□□ 2.43
TRIM54-201ENST00000296098 FOXO3O43524 673 aa30.2■■■□□ 2.42
TRIM54-201ENST00000296098 RTL1A6NKG5 1358 aa30.18■■■□□ 2.42
TRIM54-201ENST00000296098 C1orf115Q9H7X2 142 aa30.18■■■□□ 2.42
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TRIM54-201ENST00000296098 RGS12O14924 1447 aa30.17■■■□□ 2.42
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TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D32Q96NH3 1257 aa30.16■■■□□ 2.42
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TRIM54-201ENST00000296098 C14orf37Q86TY3 774 aa30.14■■■□□ 2.42
TRIM54-201ENST00000296098 USP35Q9P2H5 1018 aa30.14■■■□□ 2.42
TRIM54-201ENST00000296098 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
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TRIM54-201ENST00000296098 NFAT5O94916 1531 aa30.12■■■□□ 2.41
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TRIM54-201ENST00000296098 BECN1Q14457 450 aa30.1■■■□□ 2.41
TRIM54-201ENST00000296098 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.1■■■□□ 2.41
TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 MAP3K5Q99683 1374 aa30.07■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 GNAT3A8MTJ3 354 aa30.06■■■□□ 2.4
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TRIM54-201ENST00000296098 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
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TRIM54-201ENST00000296098 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 SLC4A2P04920 1241 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 PSME1Q06323 249 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 ATP10DQ9P241 1426 aa30.03■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 IP6K1Q92551 441 aa30.02■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 BMP2KLQ5H9B9 411 aa30.01■■■□□ 2.4
TRIM54-201ENST00000296098 KCNH5Q8NCM2 988 aa30■■■□□ 2.39
TRIM54-201ENST00000296098 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.99■■■□□ 2.39
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TRIM54-201ENST00000296098 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.98■■■□□ 2.39
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TRIM54-201ENST00000296098 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
TRIM54-201ENST00000296098 STK31Q9BXU1 1019 aa29.96■■■□□ 2.39
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TRIM54-201ENST00000296098 IL17REQ8NFR9 667 aa29.95■■■□□ 2.39
TRIM54-201ENST00000296098 DCTPP1Q9H773 170 aa29.95■■■□□ 2.39
TRIM54-201ENST00000296098 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
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TRIM54-201ENST00000296098 G2E3Q7L622 706 aa29.94■■■□□ 2.38
TRIM54-201ENST00000296098 CEP85Q6P2H3 762 aa29.93■■■□□ 2.38
TRIM54-201ENST00000296098 MEIS3Q99687 375 aa29.93■■■□□ 2.38
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TRIM54-201ENST00000296098 ORAI2Q96SN7 254 aa29.91■■■□□ 2.38
TRIM54-201ENST00000296098 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.91■■■□□ 2.38
TRIM54-201ENST00000296098 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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TRIM54-201ENST00000296098 NBPF4Q96M43 638 aa29.9■■■□□ 2.38
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.89■■■□□ 2.38
TRIM54-201ENST00000296098 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TRIM54-201ENST00000296098 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.88■■■□□ 2.37
TRIM54-201ENST00000296098 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.88■■■□□ 2.37
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TRIM54-201ENST00000296098 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.8■■■□□ 2.36
TRIM54-201ENST00000296098 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
TRIM54-201ENST00000296098 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.79■■■□□ 2.36
TRIM54-201ENST00000296098 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
TRIM54-201ENST00000296098 TTC22Q5TAA0 569 aa29.78■■■□□ 2.36
TRIM54-201ENST00000296098 GNAI2P04899 355 aa29.78■■■□□ 2.36
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