RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293604.10

C6orf136-201, Transcript of chromosome 6 open reading frame 136, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf136, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf136-201ENST00000293604 LTN1O94822 1766 aa27.46■■□□□ 1.99
C6orf136-201ENST00000293604 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.46■■□□□ 1.99
C6orf136-201ENST00000293604 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.46■■□□□ 1.99
C6orf136-201ENST00000293604 EYA1Q99502 592 aa27.45■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 VAMP4O75379 141 aa27.44■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 DCCP43146 1447 aa27.44■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.44■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 FAM83GA6ND36 823 aa27.43■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.43■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.42■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.42■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.41■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.4■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 ORAI2Q96SN7 254 aa27.4■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.4■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 SLIT3O75094 1523 aa27.4■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 IP6K1Q92551 441 aa27.39■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.39■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
C6orf136-201ENST00000293604 DCTN1Q14203 1278 aa27.39■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 MST1RQ04912 1400 aa27.38■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 CHL1O00533 1208 aa27.38■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.37■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 KIAA0232Q92628 1395 aa27.37■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.36■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 CRB1P82279 1406 aa27.36■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 FOXO3O43524 673 aa27.36■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 TSPYL6Q8N831 410 aa27.35■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 TMEM94Q12767 1356 aa27.34■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 NUCB1Q02818 461 aa27.33■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 MCM10Q7L590 875 aa27.33■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 ATF3P18847 181 aa27.33■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.33■■□□□ 1.97
C6orf136-201ENST00000293604 LRRC37A3O60309 1634 aa27.32■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.31■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.31■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 GCP02774 474 aa27.29■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 ALS2Q96Q42 1657 aa27.29■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.27■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.27■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 FAM43AQ8N2R8 423 aa27.27■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
C6orf136-201ENST00000293604 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.26■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 GCC1Q96CN9 775 aa27.26■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 HSCBQ8IWL3 235 aa27.26■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 MAP3K5Q99683 1374 aa27.26■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.25■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 SNX21Q969T3 373 aa27.25■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 ABCC4O15439 1325 aa27.25■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 MCM4P33991 863 aa27.24■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.24■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 BMP2KLQ5H9B9 411 aa27.24■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 BABAM1Q9NWV8 329 aa27.24■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 HSPA2P54652 639 aa27.23■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 NCAPD2Q15021 1401 aa27.23■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 MSH6P52701 1360 aa27.23■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.21■■□□□ 1.95
C6orf136-201ENST00000293604 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa27.2■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 NBPF6Q5VWK0 638 aa27.2■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.2■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 NBPF4Q96M43 638 aa27.2■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 STRCQ7RTU9 1775 aa27.19■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.19■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 PTPRCP08575 1304 aa27.17■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.16■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.16■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.16■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 LNPKQ9C0E8 428 aa27.16■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 DDIT3P35638 169 aa27.15■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 FSD2A1L4K1 749 aa27.15■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 ZBTB7CA1YPR0 619 aa27.15■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 LMO7Q8WWI1 1683 aa27.14■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 KRT24Q2M2I5 525 aa27.14■■□□□ 1.94
C6orf136-201ENST00000293604 IL17REQ8NFR9 667 aa27.13■■□□□ 1.93
C6orf136-201ENST00000293604 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa27.13■■□□□ 1.93
C6orf136-201ENST00000293604 ABCC6O95255 1503 aa27.13■■□□□ 1.93
C6orf136-201ENST00000293604 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
C6orf136-201ENST00000293604 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms