RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.58■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 IFT57Q9NWB7 429 aa20.58■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 SPG7Q9UQ90 795 aa20.58■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 FAM177BA6PVY3 158 aa20.58■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.58■□□□□ 0.89
TRPC1-201ENST00000273482 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.58■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 MLH3Q9UHC1 1453 aa20.58■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 F6X3S4 739 aa20.58■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 SYCE3A1L190 88 aa20.57■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 MCM2P49736 904 aa20.57■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 RLBP1P12271 317 aa20.57■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 ABCC11Q96J66 1382 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 BECN2A8MW95 431 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 MBIPQ9NS73 344 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 GNAI2P04899 355 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 CABLES1Q8TDN4 633 aa20.56■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.55■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 ERC2O15083 957 aa20.55■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.54■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.54■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.53■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 CCDC27Q2M243 656 aa20.53■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 FIBPO43427 364 aa20.53■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 NEUROD6Q96NK8 337 aa20.53■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.52■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 ADAMTS2O95450 1211 aa20.52■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 PTPRTO14522 1441 aa20.52■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.52■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.52■□□□□ 0.88
TRPC1-201ENST00000273482 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.52■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 H3BQV1 296 aa20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 IFFO2Q5TF58 517 aa20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 BICD2Q8TD16 824 aa20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 ORAI2Q96SN7 254 aa20.51■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 TPM4P67936 248 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 PIK3C2GO75747 1445 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 SIL1Q9H173 461 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.5■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 ANXA1P04083 346 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 KRT24Q2M2I5 525 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 TOMM22Q9NS69 142 aa20.49■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 SPC24Q8NBT2 197 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.48■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 SRGAP3O43295 1099 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 METP08581 1390 aa20.47■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 TSPYL6Q8N831 410 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 EYA1Q99502 592 aa20.46■□□□□ 0.87
TRPC1-201ENST00000273482 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 TPM3P06753 285 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 SNX21Q969T3 373 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 KIF3AQ9Y496 699 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 TRPM2O94759 1503 aa20.45■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 TRIM5Q9C035 493 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 NUCB1Q02818 461 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.44■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 GCP02774 474 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.43■□□□□ 0.86
TRPC1-201ENST00000273482 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms