RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RUNDC1Q96C34 613 aa26.8■■□□□ 1.88
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 GLI3P10071 1580 aa26.8■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NGEFQ8N5V2 710 aa26.79■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 DISP2A7MBM2 1401 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APAF1O14727 1248 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BARGINQ6ZT62 677 aa26.77■■□□□ 1.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A0G2JS52 829 aa26.76■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYT1Q01538 1121 aa26.76■■□□□ 1.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF521Q96K83 1311 aa26.74■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.73■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEFMP07197 916 aa26.7■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEUROD2Q15784 382 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.69■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EXOC5O00471 708 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDB1Q16531 1140 aa26.68■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPG7Q9UQ90 795 aa26.67■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP27B1O15528 508 aa26.66■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NFE2L2Q16236 605 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.65■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLGA2Q08379 1002 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.64■■□□□ 1.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRRC37A3O60309 1634 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TNS2Q63HR2 1409 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC27Q2M243 656 aa26.63■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIPK4P57078 832 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.62■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PHKG2P15735 406 aa26.61■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM182BQ5T319 152 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 WWC1Q8IX03 1113 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGS12O14924 1447 aa26.6■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.59■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCTN1Q14203 1278 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.58■■□□□ 1.85
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLFN5Q08AF3 891 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K5Q99683 1374 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.57■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MCM10Q7L590 875 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LGR6Q9HBX8 967 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.56■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 E9PSI1 815 aa26.55■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR63Q8IWG1 891 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL17REQ8NFR9 667 aa26.54■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.52■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FKBP8Q14318 412 aa26.5■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF5Q96JK2 942 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNQ2O43526 872 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 EP400Q96L91 3159 aa26.43■■□□□ 1.82
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.42■■□□□ 1.82
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