RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233121.6

MAPRE3-201, Transcript of microtubule associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MAPRE3, Length 1,892 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3-201ENST00000233121 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 LTN1O94822 1766 aa23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 NWD1Q149M9 1564 aa23.1■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 C14orf37Q86TY3 774 aa23.09■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
MAPRE3-201ENST00000233121 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.07■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 FOXO3O43524 673 aa23.07■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 PSME1Q06323 249 aa23.07■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 LRRC37A3O60309 1634 aa23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 NFAT5O94916 1531 aa23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 PTPRCP08575 1304 aa23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 GCC1Q96CN9 775 aa23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 NUCB1Q02818 461 aa23.04■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.04■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.04■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 USP19O94966 1318 aa23.03■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 KRT24Q2M2I5 525 aa23.03■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 IP6K1Q92551 441 aa23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3-201ENST00000233121 SEC24BO95487 1268 aa23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.01■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 RGS12O14924 1447 aa23■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 MAP3K5Q99683 1374 aa23■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 NBR1Q14596 966 aa23■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 CACNA1FO60840 1977 aa22.99■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 KIF1AQ12756 1690 aa22.98■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 LNPKQ9C0E8 428 aa22.96■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
MAPRE3-201ENST00000233121 MSH6P52701 1360 aa22.95■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 SLIT3O75094 1523 aa22.95■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 SLC4A2P04920 1241 aa22.95■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 ORAI2Q96SN7 254 aa22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.94■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 SLC4A3P48751 1232 aa22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 BECN1Q14457 450 aa22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 STK31Q9BXU1 1019 aa22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 IL17REQ8NFR9 667 aa22.92■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.91■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 USP35Q9P2H5 1018 aa22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 NBPF4Q96M43 638 aa22.9■■□□□ 1.26
MAPRE3-201ENST00000233121 GCP02774 474 aa22.89■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.89■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.89■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 ATP10DQ9P241 1426 aa22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 DCTPP1Q9H773 170 aa22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.88■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.87■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 MST1RQ04912 1400 aa22.86■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 G2E3Q7L622 706 aa22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 NCAPD2Q15021 1401 aa22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 CEP85Q6P2H3 762 aa22.85■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.84■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 MEIS3Q99687 375 aa22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.83■■□□□ 1.25
MAPRE3-201ENST00000233121 DCCP43146 1447 aa22.83■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 FLIIQ13045 1269 aa22.83■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.83■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 ALS2Q96Q42 1657 aa22.83■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.83■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.81■■□□□ 1.24
MAPRE3-201ENST00000233121 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms