RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641106.1

CASC19-211, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,184 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-211ENST00000641106 UBXN1Q04323 297 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TLE3Q04726 772 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 RALGDSQ12967 914 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 MAMLD1Q13495 774 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ACAP1Q15027 740 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CDKN3Q16667 212 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 LCE1DQ5T752 114 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 AFMIDQ63HM1 303 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 MACC1Q6ZN28 852 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PCDH19Q8TAB3 1148 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 LMX1AQ8TE12 382 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 DIO2Q92813 273 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CNPY3Q9BT09 278 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SLC39A8Q9C0K1 460 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ASCL3Q9NQ33 180 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 DKK3Q9UBP4 350 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.19□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 RP1P56715 2156 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 NEMP2A6NFY4 417 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TPP1O14773 563 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 AURKAO14965 403 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 USP12O75317 370 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TM7SF2O76062 418 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TIAF1O95411 115 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ALPPL2P10696 532 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 C6P13671 934 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TCF4P15884 667 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TSHRP16473 764 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FERP16591 822 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 MMP12P39900 470 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SCAND1P57086 179 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TPI1P60174 286 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CCDC173Q0VFZ6 552 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SGCGQ13326 291 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ACAP2Q15057 778 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ISXQ2M1V0 245 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ALG11Q2TAA5 492 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PARP15Q460N3 678 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 BROXQ5VW32 411 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TTC7BQ86TV6 843 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CAMK1DQ8IU85 385 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PELI3Q8N2H9 469 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 VPS37AQ8NEZ2 397 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FGF11Q92914 225 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FBXW5Q969U6 566 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ECHDC3Q96DC8 303 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TBATAQ96M53 351 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 USP29Q9HBJ7 922 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ANO10Q9NW15 660 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 OXSMQ9NWU1 459 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 HPCAL4Q9UM19 191 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa7.18□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 CPED1A4D0V7 1026 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 KLHL33A6NCF5 533 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TMEM191CA6NGB0 347 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TMCO5BA8MYB1 307 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 LMO7DNF2Z398 122 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 YY2O15391 372 aa7.17□□□□□ -1.26
CASC19-211ENST00000641106 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms