RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637919.1

PLCB1-233, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PLCB1, Length 5,074 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-233	ENST00000637919	NPR3	P17342	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PRKACA	P17612	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RFC2	P35250	354 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	NR4A2	P43354	598 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	DNAJB13	P59910	316 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RAB10	P61026	200 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PRKCD	Q05655	676 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71	1e-7	■■□□□ 12.9
PLCB1-233	ENST00000637919	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	MARK4	Q96L34	752 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	VAT1	Q99536	393 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	E2F8	A0AVK6	867 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ARPC2	O15144	300 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	NDST3	O95803	873 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	IFNA7	P01567	189 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ITGA2	P17301	1181 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	MATN1	P21941	496 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	TGM1	P22735	817 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	F8A1	P23610	371 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	HTR2B	P41595	481 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	CBLB	Q13191	982 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	GRB14	Q14449	540 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	CCL14	Q16627	93 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	KIF18B	Q86Y91	864 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	FAM156A	Q8NDB6	213 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ALG2	Q9H553	416 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	SNX4	O95219	450 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	CST1	P01037	141 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ODC1	P11926	461 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	MTHFR	P42898	656 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ARSF	P54793	590 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	POU4F1	Q01851	419 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PRKCE	Q02156	737 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	FPGS	Q05932	587 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	LRP8	Q14114	963 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	DGCR6	Q14129	220 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	DMC1	Q14565	340 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PGM5	Q15124	567 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	FUT11	Q495W5	492 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	AP3S1	Q92572	193 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	SLC39A13	Q96H72	371 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PLCB1-233	ENST00000637919	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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