RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 PRSS42Q7Z5A4 293 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 Q8NA96 180 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 PNPLA2Q96AD5 504 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 UCK1Q9HA47 277 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 NT5MQ9NPB1 228 aa21.46■■□□□ 1.03
CAPNS1-205ENST00000588780 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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CAPNS1-205ENST00000588780 MTA2O94776 668 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ARL4DP49703 201 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 KLK7P49862 253 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 STC1P52823 247 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 INSCQ1MX18 579 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 RSC1A1Q92681 617 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 MR1Q95460 341 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ZWILCHQ9H900 591 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A0J9YYE9 177 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGAP10A1A4S6 786 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF8O76064 485 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 CLDN7O95471 211 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TRBC1P01850 177 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 NELFEP18615 380 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-205ENST00000588780 CAPZBP47756 277 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNAB1Q14722 419 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 FDCSPQ8NFU4 85 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 KLHL6Q8WZ60 621 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 PEBP4Q96S96 227 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 DNPEPQ9ULA0 475 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-205ENST00000588780 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 POLQO75417 2590 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKUB1A6NFN9 424 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 NUAK1O60285 661 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC19A1P41440 591 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 JAM2P57087 298 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 CDK18Q07002 472 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 HPS6Q86YV9 775 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 IQCKQ8N0W5 287 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC34A3Q8N130 599 aa21.43■■□□□ 1.02
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CAPNS1-205ENST00000588780 CARD9Q9H257 536 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM83DQ9H4H8 585 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ASF1BQ9NVP2 202 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 GPR83Q9NYM4 423 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 H3BRJ5 948 aa21.42■■□□□ 1.02
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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CAPNS1-205ENST00000588780 CHKBQ9Y259 395 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 FADS2P1A8MWK0 482 aa21.41■■□□□ 1.02
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CAPNS1-205ENST00000588780 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.41■■□□□ 1.02
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CAPNS1-205ENST00000588780 FCRL4Q96PJ5 515 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-205ENST00000588780 AGPAT1Q99943 283 aa21.41■■□□□ 1.02
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