RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577887.1

SNORD53B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53B, humanhuman

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Gene SNORD53B, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53B-201ENST00000577887 PGLSO95336 258 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 RECKO95980 971 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CALCAP01258 141 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 TRBC1P01850 177 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CRYABP02511 175 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 FTH1P02794 183 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 KRT1P04264 644 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SERPING1P05155 500 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 FGF1P05230 155 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 GSTM1P09488 218 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 OR56A5P0C7T3 313 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 C7P10643 843 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 THRAP10827 490 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 GZMAP12544 262 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CCL4P13236 92 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ICAM2P13598 275 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 F3P13726 295 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 TNNT1P13805 278 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 COX6B1P14854 86 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CD44P16070 742 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 TYRP1P17643 537 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CTPS1P17812 591 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PAMP19021 973 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 HLA-DPA1P20036 260 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ITGALP20701 1170 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 UGT1A1P22309 533 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ALAS2P22557 587 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CCNCP24863 283 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 MPSTP25325 297 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 AK4P27144 223 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 RPL10P27635 214 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CD1CP29017 333 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 MIPP30301 263 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 OTX2P32243 289 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 GRK3P35626 688 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 TRIM23P36406 574 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SPAM1P38567 509 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 FOLR3P41439 243 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CD86P42081 329 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 STAT5AP42229 794 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ARHGAP25P42331 645 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SLC1A1P43005 524 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ATP5OP48047 213 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PREPP48147 710 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 NR2C2P49116 596 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SPINT3P49223 89 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CARSP49589 748 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 VAV2P52735 878 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SMSP52788 366 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 METAP1P53582 386 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PMS2P54278 862 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ARSFP54793 590 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 GEMP55040 296 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 HDAC4P56524 1084 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 GSCP56915 257 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 UBASH3AP57075 661 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 MAXP61244 160 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 DYNLT1P63172 113 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 TUBB4BP68371 445 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CYP4F2P78329 520 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PRAMEP78395 509 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ARG2P78540 354 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 HSD11B2P80365 405 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SARNPP82979 210 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 NFKB2Q00653 900 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 FMO1Q01740 532 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 GSTM4Q03013 218 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 DPTQ07507 201 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CDC16Q13042 620 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 MAMLD1Q13495 774 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 DNASE1L3Q13609 305 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PKP1Q13835 747 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 TUBB2AQ13885 445 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 DPYSQ14117 519 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 MESDQ14696 234 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SSPNQ14714 243 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 KRT31Q15323 416 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 CYTH1Q15438 398 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SHBQ15464 509 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 TGIF1Q15583 401 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PHKG1Q16816 387 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SKIDA1Q1XH10 827 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 SMTNL2Q2TAL5 461 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 FAM214AQ32MH5 1076 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP1.55□□□□□ -2.16not detected■■□□□ 11.9
SNORD53B-201ENST00000577887 PYCR3Q53H96 274 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 C2CD6Q53TS8 623 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 MFSD4BQ5TF39 518 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa1.55□□□□□ -2.16
SNORD53B-201ENST00000577887 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa1.55□□□□□ -2.16
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