RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 FTCDO95954 541 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 FSD1LQ9BXM9 530 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 EPB41L5Q9HCM4 733 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 BPIFA1Q9NP55 256 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 ALDH4A1P30038 563 aa29.03■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 PIM3Q86V86 326 aa29.03■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 SPACA3Q8IXA5 215 aa29.03■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 FBXO39Q8N4B4 442 aa29.03■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 TNFSF15O95150 251 aa29.02■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 UGT1A5P35504 534 aa29.02■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 OR5K4A6NMS3 321 aa29.01■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 CCDC173Q0VFZ6 552 aa29.01■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF547Q8IVP9 402 aa29.01■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 SEMA6CQ9H3T2 930 aa29.01■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 PRORYQ9H606 182 aa29.01■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 RDH14Q9HBH5 336 aa29.01■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 ARNT2Q9HBZ2 717 aa29.01■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa29■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 KIR2DS3K7RE56 304 aa29■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 KIR2DS5Q14953 304 aa29■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 C11orf96Q7Z7L8 435 aa28.98■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 KCNE4Q8WWG9 221 aa28.98■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 SH3KBP1Q96B97 665 aa28.98■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 CMKLR1Q99788 373 aa28.98■■■□□ 2.23
RAB40C-211ENST00000568586 B3GNT4Q9C0J1 378 aa28.98■■■□□ 2.23
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RAB40C-211ENST00000568586 KCNK4Q9NYG8 393 aa28.98■■■□□ 2.23
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