RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567306.5

PDXDC1-215, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-215ENST00000567306 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-215ENST00000567306 GALPQ9UBC7 116 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-215ENST00000567306 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-215ENST00000567306 MMP17Q9ULZ9 603 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-215ENST00000567306 PLLPQ9Y342 182 aa7.4□□□□□ -1.22
PDXDC1-215ENST00000567306 F5P12259 2224 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A087X1B8 175 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 WDR91A4D1P6 747 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 K7ESM1 405 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 SLC12A2P55011 1212 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 ITGA9Q13797 1035 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 ZNF284Q2VY69 593 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 MECRQ9BV79 373 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 CLPBQ9H078 707 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.39□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 VWA7Q9Y334 891 aa7.39□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 H3BMM5 538 aa7.38□□□□□ -1.23
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PDXDC1-215ENST00000567306 SGTAO43765 313 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 VPS26AO75436 327 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 KLHL2O95198 593 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 PCDH8O95206 1070 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 PCCBP05166 539 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 SBK3P0C264 359 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 CCDC166P0CW27 439 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 ITGB6P18564 788 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 TAC1P20366 129 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 AKT1P31749 480 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 NSG1P42857 185 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 CCT5P48643 541 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 CLCN7P51798 805 aa7.38□□□□□ -1.23
PDXDC1-215ENST00000567306 SEC24CP53992 1094 aa7.38□□□□□ -1.23
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