RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 SLC38A3Q99624 504 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CMKLR1Q99788 373 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 NUDT22Q9BRQ3 303 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 FICDQ9BVA6 458 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SEMA6CQ9H3T2 930 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 WDR70Q9NW82 654 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D29Q9UFV1 150 aa18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 NBEAQ8NFP9 2946 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 GPR89AB7ZAQ6 455 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ANXA9O76027 345 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 FTCDO95954 541 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 GPR89BP0CG08 455 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SLC2A4P14672 509 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CD1CP29017 333 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SPAM1P38567 509 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 FASLGP48023 281 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 PRPSAP1Q14558 356 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 INSCQ1MX18 579 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CLEC14AQ86T13 490 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SFRP1Q8N474 314 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM159Q96B96 161 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 KLC4Q9NSK0 619 aa18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 VEGFDO43915 354 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 AGTP01019 485 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 PSMB4P28070 264 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CXADRP78310 365 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 HHEXQ03014 270 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 NFATC2Q13469 925 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 GTF2H3Q13889 308 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 FAM151BQ6UXP7 276 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 LRRTM4Q86VH4 590 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC110Q8TBZ0 833 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 VPS35Q96QK1 796 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 DPH1Q9BZG8 443 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 PRORYQ9H606 182 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 PKP3Q9Y446 797 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ADGRG1Q9Y653 693 aa18.18■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 KMOO15229 486 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CDK14O94921 469 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 F3P13726 295 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ITIH1P19827 911 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SLC5A2P31639 672 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 MAPK10P53779 464 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 TMPRSS3P57727 454 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 GPLD1P80108 840 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 IYDQ6PHW0 289 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SLC9B2Q86UD5 537 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 RCBTB1Q8NDN9 531 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 OR10G6Q8NH81 332 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SPATA13Q96N96 652 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 TTC25Q96NG3 672 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 APOL2Q9BQE5 337 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 IL26Q9NPH9 171 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 PRDM8Q9NQV8 689 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 IL17CQ9P0M4 197 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa18.17■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 A0A0G2JNG1 304 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 OR5K4A6NMS3 321 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 KIR2DS3K7RE56 304 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CHUKO15111 745 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 STX7O15400 261 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 DUX1O43812 170 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 MPSTP25325 297 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CSF2RBP32927 897 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CLCNKAP51800 687 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 UCNP55089 124 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 OLIG2Q13516 323 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 KIR2DS5Q14953 304 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CHRNA6Q15825 494 aa18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms