RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LRRK1Q38SD2 2015 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RP1P56715 2156 aa13.54□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MACROD2A1Z1Q3 448 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A8MU76 341 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C9orf172C9J069 976 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 VEGFDO43915 354 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CDK14O94921 469 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 VIPP01282 170 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 THRAP10827 490 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ETV5P41161 510 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EPHA4P54764 986 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HADHBP55084 474 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SARM1Q6SZW1 724 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LRRTM4Q86VH4 590 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLXDC1Q8IUK5 500 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KATNAL2Q8IYT4 538 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GPR26Q8NDV2 337 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BRSK1Q8TDC3 778 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ART4Q93070 314 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WDR24Q96S15 920 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DDA1Q9BW61 102 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HACD3Q9P035 362 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FOXJ2Q9P0K8 574 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KALRNO60229 2985 aa13.53□□□□□ -0.24
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EFCAB7A8K855 629 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HACD1B0YJ81 288 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 H7C0C1 242 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EFSO43281 561 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EPOP01588 193 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ITGB2P05107 769 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SFTPCP11686 197 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AMD1P17707 334 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NFKB1P19838 968 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IDSP22304 550 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HMGCLP35914 325 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HALP42357 657 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ATP5OP48047 213 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WNT3AP56704 352 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRPSAP1Q14558 356 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PPP2R5EQ16537 467 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C11orf63Q6NUN7 778 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 XKR5Q6UX68 686 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF843Q8N446 348 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC25A41Q8N5S1 370 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IPMKQ8NFU5 416 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HTR3CQ8WXA8 447 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HAUS1Q96CS2 278 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MED8Q96G25 268 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BPIFA1Q9NP55 256 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRDM8Q9NQV8 689 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RSPH14Q9UHP6 348 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa13.52□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SHROOM3Q8TF72 1996 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LRP4O75096 1905 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 B4E171 279 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PPFIA2O75334 1257 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ANXA9O76027 345 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EML2O95834 649 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BPIP17213 487 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HLA-DPA1P20036 260 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CSF2RBP32927 897 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TSPAN7P41732 249 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CLCNKAP51800 687 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COPS2P61201 443 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MPP3Q13368 585 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LY6DQ14210 128 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TAZQ16635 292 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CEACAM20Q6UY09 585 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 VASH2Q86V25 355 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TC2NQ8N9U0 490 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTC9Q92623 222 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TADA1Q96BN2 335 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 EID2BQ96D98 161 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CXorf40BQ96DE9 158 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZPBPQ9BS86 351 aa13.51□□□□□ -0.25
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TIMM29Q9BSF4 260 aa13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms