RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	NFATC4	Q14934	902 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	FAM129C	Q86XR2	697 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PELI3	Q8N2H9	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	BBS5	Q8N3I7	341 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PGBD5	Q8N414	524 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TCTN2	Q96GX1	697 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	EXOC2	Q96KP1	924 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MGME1	Q9BQP7	344 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CDH19	Q9H159	772 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NT5M	Q9NPB1	228 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	AMACR	Q9UHK6	382 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222		A8MU76	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222		H7C0C1	242 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CPNE6	O95741	557 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TNF	P01375	233 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	FGG	P02679	453 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RBP3	P10745	1247 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ATP5O	P48047	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	WASHC5	Q12768	1159 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ZBTB17	Q13105	803 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NADK2	Q4G0N4	442 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	STARD8	Q92502	1023 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	LGR4	Q9BXB1	951 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SPRY4	Q9C004	299 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	FUCA1	P04066	466 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	HLA-DQB2	P05538	268 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PTPN3	P26045	913 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RBL1	P28749	1068 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SCNN1B	P51168	640 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	BLK	P51451	505 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MAX	P61244	160 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RAD51	Q06609	339 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	GRM3	Q14832	879 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	LRRC14	Q15048	493 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SRL	Q86TD4	932 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	MS4A14	Q96JA4	679 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ZNF185	O15231	689 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PPM1D	O15297	605 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	LIAS	O43766	372 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PIGN	O95427	931 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ECEL1	O95672	775 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	AP1S1	P61966	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CCNG2	Q16589	344 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NRROS	Q86YC3	692 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	BMPER	Q8N8U9	685 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PRR7	Q8TB68	274 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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