RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TANKQ92844 425 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM237Q96Q45 408 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PANX3Q96QZ0 392 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TMED9Q9BVK6 235 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GON7Q9BXV9 100 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IFT46Q9NQC8 304 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AHSPQ9NZD4 102 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 SEC24AO95486 1093 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 ITGB8P26012 769 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 ARHGDIAP52565 204 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MPP5Q8N3R9 675 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PLD4Q96BZ4 506 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FBRSQ9HAH7 460 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IL1RL2Q9HB29 575 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RDH8Q9NYR8 311 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 COPZ2Q9P299 210 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PADI4Q9UM07 663 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 HTR3BO95264 441 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CCNE2O96020 404 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 FABP1P07148 127 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GZMAP12544 262 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM209BQ5JX69 171 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 POTEHQ6S545 545 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 OTUB2Q96DC9 234 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.27□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 PFKLP17858 780 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DIO1P49895 249 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 HK3P52790 923 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CAP1Q01518 475 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DEFA5Q01523 94 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf89Q6UX73 402 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 EID3Q8N140 333 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF561Q8N587 486 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 EMC1Q8N766 993 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 REPS1Q96D71 796 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD9Q96Q07 612 aa6.27□□□□□ -1.41
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