RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547352.1

HECTD4-204, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 1,203 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-204ENST00000547352 CHRNA4P43681 627 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SEMG2Q02383 582 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CYTH1Q15438 398 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CNGA3Q16281 694 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 DHRS13Q6UX07 377 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 GPR155Q7Z3F1 870 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SRLQ86TD4 932 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 NUDCD3Q8IVD9 361 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 PEX13Q92968 403 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ITPKCQ96DU7 683 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 NUDCD1Q96RS6 583 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RHOJQ9H4E5 214 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 GAREM1Q9H706 876 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SNX15Q9NRS6 342 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SLC17A6Q9P2U8 582 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.69□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CCDC78A2IDD5 438 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 B8ZZF3 427 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CBX4O00257 560 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 LEFTY2O00292 366 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 MUSKO15146 869 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 TRIM24O15164 1050 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SLC7A4O43246 635 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 WISP1O95388 367 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 NDST3O95803 873 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 AHSGP02765 367 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 BPGMP07738 259 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CR2P20023 1033 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 BGNP21810 368 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 GLDCP23378 1020 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ALDH3A1P30838 453 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CD151P48509 253 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SCNN1BP51168 640 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 TLE3Q04726 772 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 KDSRQ06136 332 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 LY6DQ14210 128 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 IHHQ14623 411 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 DHCR24Q15392 516 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 HLA-BQ31612 363 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CCDC153Q494R4 210 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 EOGTQ5NDL2 527 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 MPP7Q5T2T1 576 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CGB2Q6NT52 195 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RETSATQ6NUM9 610 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 NEPROQ6NW34 567 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SLC36A4Q6YBV0 504 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 LCA5Q86VQ0 697 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CCDC63Q8NA47 563 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF398Q8TD17 642 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 DDI1Q8WTU0 396 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 VPS39Q96JC1 886 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ZNF778Q96MU6 729 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ACOX2Q99424 681 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 GPR22Q99680 433 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ZFAND3Q9H8U3 227 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CFAP97Q9P2B7 532 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 TLK1Q9UKI8 766 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 USH1CQ9Y6N9 552 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.68□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 A0A096LPK6 155 aa8.67□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa8.67□□□□□ -1.02
HECTD4-204ENST00000547352 E2F8A0AVK6 867 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms