RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531524.5

BSCL2-223, Transcript of BSCL2, seipin lipid droplet biogenesis associated, human

TSL 3

Gene BSCL2, Length 844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BSCL2-223	ENST00000531524	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	GALNT2	Q10471	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	NFATC2	Q13469	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	BIRC2	Q13490	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	QPCT	Q16769	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	NADK2	Q4G0N4	442 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	FHL5	Q5TD97	284 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	HPS6	Q86YV9	775 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TEKT4	Q8WW24	435 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TADA1	Q96BN2	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TSGA13	Q96PP4	275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CDC14C	A4D256	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63	6e-9	■■■■□ 25.4
BSCL2-223	ENST00000531524	MATN3	O15232	486 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	INPP4B	O15327	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	DAPK3	O43293	454 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	VEGFD	O43915	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	VPS4B	O75351	444 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	RNF8	O76064	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	UBXN7	O94888	489 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CLDN7	O95471	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CLDN1	O95832	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	JCHAIN	P01591	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	MT-ND3	P03897	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CAPN1	P07384	714 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	RARA	P10276	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	DES	P17661	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PTPN4	P29074	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	SERPINB6	P35237	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	DCT	P40126	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PGD	P52209	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	DMPK	Q09013	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	IL10RA	Q13651	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	BECN1	Q14457	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CPZ	Q66K79	652 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BSCL2-223	ENST00000531524	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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