RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526105.5

SLC38A6-208, Transcript of solute carrier family 38 member 6, human

TSL 3

Gene SLC38A6, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A6-208	ENST00000526105	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	IL25	Q9H293	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105		A0A0G2JPF8	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	IKBKB	O14920	756 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ENTPD3	O75355	529 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	AVIL	O75366	819 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	TUBB	P07437	444 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	S1PR1	P21453	382 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	CCKBR	P32239	447 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71	8e-6	■■■■□ 21
SLC38A6-208	ENST00000526105	ARSE	P51690	589 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	STAT2	P52630	851 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KRT33B	Q14525	404 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KCTD2	Q14681	263 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PIGT	Q969N2	578 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	BICD1	Q96G01	975 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	DDO	Q99489	341 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PADI3	Q9ULW8	664 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	CLGN	O14967	610 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZBTB43	O43298	467 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PLPP2	O43688	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	VPREB1	P12018	145 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	SELL	P14151	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	AKR1B1	P15121	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	AMPH	P49418	695 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	MMP14	P50281	582 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PDLIM4	P50479	330 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	CLDN20	P56880	219 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMF1	P82094	1093 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	PCLAF	Q15004	111 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	MEP1A	Q16819	746 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	FIG4	Q92562	907 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
SLC38A6-208	ENST00000526105	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.36	□□□□□ -1.71

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