RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517088.1

RNU6-685P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 685, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-685P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-685P-201ENST00000517088 DLG2Q15700 870 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MYLK3Q32MK0 819 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PMS2CLQ68D20 193 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 JADE1Q6IE81 842 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM171BQ6P995 826 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ASB18Q6ZVZ8 466 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATG9AQ7Z3C6 839 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SZRD1Q7Z422 152 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KMT5CQ86Y97 462 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ADGRF2Q8IZF7 708 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SYT17Q9BSW7 474 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 LRMDAQ9H2I8 198 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 GHITMQ9H3K2 345 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SYNCQ9H7C4 482 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DNAJC18Q9H819 358 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 VPS28Q9UK41 221 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CMAHPQ9Y471 501 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 LILRA5A6NI73 299 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PRSS47A8MTI9 375 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MAP2K7O14733 419 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KCNN4O15554 427 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 WDR1O75083 606 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 HIST1H2ABP04908 130 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TUBBP07437 444 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CETPP11597 493 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 HIST1H2ADP20671 130 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 UGT1A1P22309 533 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 HRH2P25021 359 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 HOXD13P35453 343 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FASLGP48023 281 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MFAP4P55083 255 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PLIN5Q00G26 463 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CREB5Q02930 508 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 UBE2V1Q13404 147 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 GTF2H2Q13888 395 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF234Q14588 700 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 MEA1Q16626 185 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 LCN10Q6JVE6 187 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TRNP1Q6NT89 227 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 C9orf139Q6ZV77 190 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SCYL3Q8IZE3 742 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 NAGSQ8N159 534 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 EMC1Q8N766 993 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 IL17RCQ8NAC3 791 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 OR52I2Q8NH67 350 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF583Q96ND8 569 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DDOQ99489 341 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 EPYCQ99645 322 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 SIL1Q9H173 461 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF556Q9HAH1 456 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 EBF2Q9HAK2 575 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ABCF3Q9NUQ8 709 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KLHL9Q9P2J3 617 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ICAM5Q9UMF0 924 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PCDHGB4Q9UN71 923 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 GPR34Q9UPC5 381 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 AGAP14A8MT82 685 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 B4DLN1 442 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 C16orf97H3BN30 126 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 PLK4O00444 970 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CTDSP2O14595 271 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 DVL1O14640 695 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 CAPN9O14815 690 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNHIT1O43257 154 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ZNF432O94892 652 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 F7P08709 466 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 KRT19P08727 400 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-685P-201ENST00000517088 ACTN1P12814 892 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms