RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RTL4Q6ZR62 310 aa4.5□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.5□□□□□ -1.69
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STUB1Q9UNE7 303 aa4.5□□□□□ -1.69
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SPATA13Q96N96 652 aa4.5□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OMDQ99983 421 aa4.5□□□□□ -1.69
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RBL2Q08999 1139 aa4.5□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MANEAQ5SRI9 462 aa4.5□□□□□ -1.69
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMPRSS6Q8IU80 811 aa4.5□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.5□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM71DQ8N9W8 422 aa4.5□□□□□ -1.69
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GABPB1-AS1-202ENST00000499624 H0Y858 1186 aa4.5□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CCRL2O00421 344 aa4.5□□□□□ -1.69
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCN2BO60939 215 aa4.5□□□□□ -1.69
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