RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494544.1

CP-213, Transcript of ceruloplasmin, human

TSL 1 (best)

Gene CP, Length 2,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CP-213	ENST00000494544	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	LAMP2	P13473	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ITGAL	P20701	1170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	SERPINB5	P36952	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PSMD8	P48556	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	EPHA5	P54756	1037 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	RAB30	Q15771	203 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	CCDC153	Q494R4	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544		Q7L0L9	218 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62	3e-8	■■■■■ 46.1
CP-213	ENST00000494544	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	GBF1	Q92538	1859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	LTBP2	Q14767	1821 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PFDN6	O15212	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	LAT	O43561	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	DCX	O43602	365 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	VPS26A	O75436	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	FGF19	O95750	216 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	SERPINE1	P05121	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	SBK3	P0C264	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	CD1E	P15812	388 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	CRABP2	P29373	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	IL12RB1	P42701	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	SCTR	P47872	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TTPA	P49638	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	GALK1	P51570	392 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	KCNJ2	P63252	427 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	NFATC2	Q13469	925 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	HSD11B1L	Q7Z5J1	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	CCT6B	Q92526	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CP-213	ENST00000494544	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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