RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 PKMP14618 531 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SLC7A2P52569 658 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 KANK2Q63ZY3 851 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TMEM150AQ86TG1 271 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CPNE9Q8IYJ1 553 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TTC30BQ8N4P2 665 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ZFP28Q8NHY6 868 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 FAM110BQ8TC76 370 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 FAM210AQ96ND0 272 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SLC25A23Q9BV35 468 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TM6SF2Q9BZW4 377 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 HIPK3Q9H422 1215 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MAP10Q9P2G4 905 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ZNF225Q9UK10 706 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CROTQ9UKG9 612 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 BACE2Q9Y5Z0 518 aa12.76□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 A0A0J9YYE9 177 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12.75□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 10
PRAME-213ENST00000492657 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 GKP32189 559 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 DIO3P55073 304 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MAPRE2Q15555 327 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TXNDC8Q6A555 127 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 NCEH1Q6PIU2 408 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CHST9Q7L1S5 443 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ACOX2Q99424 681 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 LHX3Q9UBR4 397 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 POLG2Q9UHN1 485 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 AP4B1Q9Y6B7 739 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ABLIM3O94929 683 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CSPG5O95196 566 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 HGFP14210 728 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CAPN3P20807 821 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 RPL10P27635 214 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 STX1BP61266 288 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ANKS6Q68DC2 871 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ZFP1Q6P2D0 407 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SYVN1Q86TM6 617 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 LINGO1Q96FE5 620 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 DEFB118Q96PH6 123 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 PLK2Q9NYY3 685 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CD300AQ9UGN4 299 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SARDHQ9UL12 918 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MYO7AQ13402 2215 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ITGB6P18564 788 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 APLP1P51693 650 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CDKL1Q00532 357 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 LCP2Q13094 533 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MTA1Q13330 715 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MAP7Q14244 749 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MYLK3Q32MK0 819 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CAMK1DQ8IU85 385 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CD200R1Q8TD46 325 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 OVCA2Q8WZ82 227 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ASB9Q96DX5 294 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 MYRFLQ96LU7 910 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 FEM1AQ9BSK4 669 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 Q9H521 79 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 LZTS1Q9Y250 596 aa12.75□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 A8MX80 341 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 PRRG1O14668 218 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CLPTM1O96005 669 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CSKP41240 450 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 RHOAP61586 193 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 HPCAP84074 193 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SEMG2Q02383 582 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SLCO4A1Q96BD0 722 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TEX37Q96LM6 180 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 CDK15Q96Q40 435 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TCF12Q99081 682 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 ADGRE3Q9BY15 652 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 SPAG4Q9NPE6 437 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 TMEM181Q9P2C4 612 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 BCAP29Q9UHQ4 241 aa12.74□□□□□ -0.37
PRAME-213ENST00000492657 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms