RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	AMER2	Q8N7J2	671 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	THRSP	Q92748	146 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	MR1	Q95460	341 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PBK	Q96KB5	322 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CATSPER2	Q96P56	530 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PKP4	Q99569	1192 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	MYH8	P13535	1937 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	AGL	P35573	1532 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592		E9PBE3	544 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592		H0YHG0	523 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PSMD9	O00233	223 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	MPPED1	O15442	326 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RGS10	O43665	173 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CYTIP	O60759	359 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	FLOT1	O75955	427 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ESRRB	O95718	433 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	GLP2R	O95838	553 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	BMP15	O95972	392 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	FYN	P06241	537 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ANXA6	P08133	673 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PRLR	P16471	622 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CTNNA2	P26232	953 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	GABRB3	P28472	473 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TNFRSF8	P28908	595 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	SLC8A1	P32418	973 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	FOLR3	P41439	243 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	FNTA	P49354	379 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	LIG4	P49917	911 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	AP3M2	P53677	418 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	BCAT1	P54687	386 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CASP9	P55211	416 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	MAP3K7CL	P57077	242 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	STX1B	P61266	288 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	SP2	Q02086	613 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	TAP1	Q03518	808 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PTPRR	Q15256	657 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	NPY5R	Q15761	445 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	EMB	Q6PCB8	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RTN4-215	ENST00000491592	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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