RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491013.5

FDPS-216, Transcript of farnesyl diphosphate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene FDPS, Length 912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPS-216ENST00000491013 CCNJLQ8IV13 435 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 OR4K2Q8NGD2 314 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 PATE1Q8WXA2 126 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 KCTD3Q9Y597 815 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 AK5Q9Y6K8 562 aa14.51□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 D6RAR5 112 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 KMOO15229 486 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LDB2O43679 373 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 MTX2O75431 263 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CDK14O94921 469 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 EML2O95834 649 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 FGGP02679 453 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CA5AP35218 305 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 FDFT1P37268 417 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 GPR3P46089 330 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 FASLGP48023 281 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SNX1Q13596 522 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LRRTM4Q86VH4 590 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SFRP1Q8N474 314 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ZNF398Q8TD17 642 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SMOXQ9NWM0 555 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 TBC1D29Q9UFV1 150 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 KCNK6Q9Y257 313 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CHD6Q8TD26 2715 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LAMA5O15230 3695 aa14.5□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 A6NCN8 305 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 AGAP14A8MT82 685 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 PPM1DO15297 605 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 GPR39O43194 453 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 B4GAT1O43505 415 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CEP104O60308 925 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 PRAMEF1O95521 474 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 IFNB1P01574 187 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CXCR5P32302 372 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ACTN2P35609 894 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LSSP48449 732 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 XIAPP98170 497 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 IYDQ6PHW0 289 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LINC00523Q86TU6 105 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 GDAP1Q8TB36 358 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 TIMM29Q9BSF4 260 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ETNK1Q9HBU6 452 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 KLC4Q9NSK0 619 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.49□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 PRR19A6NJB7 356 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 OR5K4A6NMS3 321 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ZW10O43264 779 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ZSCAN12O43309 604 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 BRINP1O60477 761 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SUN1O94901 812 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 F3P13726 295 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SLC2A4P14672 509 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ETS1P14921 441 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 TPH1P17752 444 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CCKBRP32239 447 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 HADHAP40939 763 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 OR1D5P58170 312 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 BIRC2Q13490 618 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 GTF2H3Q13889 308 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LSMEM2Q8N112 164 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
FDPS-216ENST00000491013 TTC25Q96NG3 672 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms