RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	LEMD2	Q8NC56	503 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	WBP2	Q969T9	261 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SKA1	Q96BD8	255 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	LMLN	Q96KR4	655 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR78	Q96P69	363 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM237	Q96Q45	408 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RAD9A	Q99638	391 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SEMA3C	Q99985	751 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NACA2	Q9H009	215 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KCNK13	Q9HB14	408 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GKN1	Q9NS71	199 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	E2F8	A0AVK6	867 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RASSF9	O75901	435 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	UNC5C	O95185	931 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	VAPB	O95292	243 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PRL	P01236	227 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPNS1	P04632	268 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RB1	P06400	928 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SYP	P08247	313 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SBK3	P0C264	359 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MYL4	P12829	197 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CPA3	P15088	417 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HDC	P19113	662 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SERPINB5	P36952	375 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC1A2	P43004	574 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NUMB	P49757	651 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SGSH	P51688	502 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DNAJB13	P59910	316 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB10	P61026	200 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MAX	P61244	160 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	AP1S1	P61966	158 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZXDB	P98169	803 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FPGS	Q05932	587 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC20A2	Q08357	652 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	STX3	Q13277	289 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC12A1	Q13621	1099 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	GRM3	Q14832	879 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT72	Q14CN4	511 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CHI3L2	Q15782	390 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MPPE1	Q53F39	396 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	INPP5D	Q92835	1189 aa		5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
ATG4A-208	ENST00000489247	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52

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