RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486016.1

GCFC2-209, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

TSL 3

Gene GCFC2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-209ENST00000486016 ARHGEF9O43307 516 aa3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 NADKO95544 446 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 MLYCDO95822 493 aa3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 MCCP23508 829 aa3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 ABCD1P33897 745 aa3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 MLLT10P55197 1068 aa3.53□□□□□ -1.84
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GCFC2-209ENST00000486016 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
GCFC2-209ENST00000486016 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.53□□□□□ -1.84
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GCFC2-209ENST00000486016 ANKRD66B4E2M5 251 aa3.51□□□□□ -1.85
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GCFC2-209ENST00000486016 MOCOSQ96EN8 888 aa3.51□□□□□ -1.85
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GCFC2-209ENST00000486016 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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GCFC2-209ENST00000486016 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.5□□□□□ -1.85
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GCFC2-209ENST00000486016 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
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GCFC2-209ENST00000486016 FLT1P17948 1338 aa3.49□□□□□ -1.85
GCFC2-209ENST00000486016 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa3.49□□□□□ -1.85
GCFC2-209ENST00000486016 MEIOCA2RUB1 952 aa3.49□□□□□ -1.85
GCFC2-209ENST00000486016 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
GCFC2-209ENST00000486016 F9P00740 461 aa3.49□□□□□ -1.85
GCFC2-209ENST00000486016 HSD3B1P14060 373 aa3.49□□□□□ -1.85
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