RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485604.1

PHF20-212, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene PHF20, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-212ENST00000485604 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CD84Q9UIB8 345 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CHKBQ9Y259 395 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.3□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 A0A0G2JK05 382 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 LRRD1A4D1F6 860 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 LILRA5A6NI73 299 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 B4E171 279 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CHUKO15111 745 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PPM1DO15297 605 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PSTPIP1O43586 416 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 LCA5LO95447 670 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CLDN7O95471 211 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CCL4P13236 92 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CA4P22748 312 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PTPN3P26045 913 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 GJC1P36383 396 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TSPAN7P41732 249 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ACTR1BP42025 376 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CD86P42081 329 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ARHGAP25P42331 645 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CDKN2BP42772 138 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 GPR1P46091 355 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 MARCKSL1P49006 195 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CLCNKAP51800 687 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 EPHA4P54764 986 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 OR1D5P58170 312 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ACTR1AP61163 376 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TPM4P67936 248 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 GPLD1P80108 840 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ADCY2Q08462 1091 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 WASHC5Q12768 1159 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ARHGEF7Q14155 803 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 GALNT3Q14435 633 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TGIF1Q15583 401 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 IGFBP7Q16270 282 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 LINC00303Q3SY05 128 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 MAP9Q49MG5 647 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 FAM182AQ5T1J6 154 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 DENND2CQ68D51 928 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 DOK6Q6PKX4 331 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 KDELC1Q6UW63 502 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 XKR5Q6UX68 686 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ZFAND4Q86XD8 727 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 EXD3Q8N9H8 876 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 RCBTB1Q8NDN9 531 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 EXD1Q8NHP7 514 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 DTX3LQ8TDB6 740 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CPLX3Q8WVH0 158 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 HTR3CQ8WXA8 447 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CHP1Q99653 195 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CMKLR1Q99788 373 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 DDA1Q9BW61 102 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CEP41Q9BYV8 373 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 SPRY4Q9C004 299 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 CARD9Q9H257 536 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 RMI1Q9H9A7 625 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 UCK1Q9HA47 277 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 SPTLC3Q9NUV7 552 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 OGFRQ9NZT2 677 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 PISDQ9UG56 409 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 METRNQ9UJH8 293 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 INTUQ9ULD6 942 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa4.29□□□□□ -1.72
PHF20-212ENST00000485604 ZNF711Q9Y462 761 aa4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms