RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479541.1

RNF216-208, Transcript of ring finger protein 216, human

TSL 4

Gene RNF216, Length 580 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF216-208	ENST00000479541	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MYBL1	P10243	752 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	NAGA	P17050	411 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MAOA	P21397	527 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GNLY	P22749	145 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GPR143	P51810	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SELENOV	P59797	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GPR18	Q14330	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PTGR1	Q14914	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MMP21	Q8N119	569 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GAD1	Q99259	594 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MYOM2	P54296	1465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CASZ1	Q86V15	1759 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		A0A1B0GVM2	712 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	UBE2C	O00762	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	VNN2	O95498	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TUBB	P07437	444 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GJA1	P17302	382 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ACADL	P28330	430 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	STX2	P32856	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MSH2	P43246	934 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	P2RX3	P56373	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	SREBF2	Q12772	1141 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	KRT33B	Q14525	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541		Q4G0T1	1027 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67	4e-7	■■■□□ 15.6
RNF216-208	ENST00000479541	ERGIC1	Q969X5	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MMP27	Q9H306	513 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ADGRB2	O60241	1585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ADGRB3	O60242	1522 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	MAP2K7	O14733	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	EPN2	O95208	641 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GGPS1	O95749	300 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	FTCD	O95954	541 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	GH2	P01242	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	QDPR	P09417	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RNF216-208	ENST00000479541	VPREB1	P12018	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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