RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.15■■□□□ 1.3
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C9orf3-215ENST00000478473 C16orf72Q14CZ0 275 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf3-215ENST00000478473 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
C9orf3-215ENST00000478473 AMZ1Q400G9 498 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf3-215ENST00000478473 DENND5AQ6IQ26 1287 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM71Q6P5X7 295 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf3-215ENST00000478473 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa23.1■■□□□ 1.29
C9orf3-215ENST00000478473 USP53Q70EK8 1073 aa23.1■■□□□ 1.29
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