RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472189.1

NCOR1-215, Transcript of nuclear receptor corepressor 1, human

TSL 2

Gene NCOR1, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCOR1-215	ENST00000472189	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	TEX11	Q8IYF3	940 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	DNAJC18	Q9H819	358 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189		Q9N2J8	555 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189		A6NNC1	897 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	STX16	O14662	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	SYN3	O14994	580 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	NDUFB8	O95169	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	METTL18	O95568	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	BAG3	O95817	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	CHRNB1	P11230	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	SLC16A2	P36021	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	CYP2J2	P51589	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	MVD	P53602	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	GAD2	Q05329	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	KCNC3	Q14003	757 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ALG10	Q5BKT4	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	WASF1	Q92558	559 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NCOR1-215	ENST00000472189	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189		B4DGG1	531 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	VWA5A	O00534	786 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ATP2A1	O14983	1001 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	EPN2	O95208	641 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	NTN1	O95631	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	FGF2	P09038	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	KLRC2	P26717	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	STARD6	P59095	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	KRT32	Q14532	448 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	BAK1	Q16611	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NCOR1-215	ENST00000472189	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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