RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SPRED1	Q7Z699	444 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NAGS	Q8N159	534 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	STRADB	Q9C0K7	418 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	RDH14	Q9HBH5	336 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	KLC4	Q9NSK0	619 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQM1	296 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf60	A6NFR6	353 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880		E7EVH7	732 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NUAK1	O60285	661 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CRTAM	O95727	393 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NFATC2	Q13469	925 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PARP6	Q2NL67	630 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	P3H1	Q32P28	736 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	JAML	Q86YT9	394 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC89	Q8N998	374 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM58	Q8NG06	486 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SLC38A3	Q99624	504 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	IL26	Q9NPH9	171 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	IL17C	Q9P0M4	197 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	APPL1	Q9UKG1	709 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	KMO	O15229	486 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LIAS	O43766	372 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF1	O95521	474 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	METTL18	O95568	372 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SLC2A4	P14672	509 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PNLIP	P16233	465 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TPH1	P17752	444 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ITGA9	Q13797	1035 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	RANBP10	Q6VN20	620 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	DET1	Q7L5Y6	550 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PIM3	Q86V86	326 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM74	Q96NL1	305 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ASB8	Q9H765	288 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	DKK4	Q9UBT3	224 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	KCTD3	Q9Y597	815 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LAMA5	O15230	3695 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC78	A2IDD5	438 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CCL22	O00626	93 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	VEGFD	O43915	354 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CEP104	O60308	925 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	TNFSF15	O95150	251 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	EML2	O95834	649 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	JMJD7	P0C870	316 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	VCL	P18206	1134 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	MSH3	P20585	1137 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	CXCR5	P32302	372 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	ADRA1A	P35348	466 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LSS	P48449	732 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	HHEX	Q03014	270 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	POU6F1	Q14863	301 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SSR4-208	ENST00000471880	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07

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