RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	ADRB2	P07550	413 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SRC	P12931	536 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	IL11	P20809	199 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SSTR2	P30874	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	FASLG	P48023	281 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PDLIM4	P50479	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DLG1	Q12959	904 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TNFAIP1	Q13829	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CTF1	Q16619	201 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM198	Q66K66	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KBTBD6	Q86V97	674 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	BICD1	Q96G01	975 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	HS3ST1	O14792	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	AVIL	O75366	819 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RFPL2	O75678	378 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CSPG5	O95196	566 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DNTT	P04053	509 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MMP9	P14780	707 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MMP14	P50281	582 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	4.07	□□□□□ -1.76	1e-8	■□□□□ 8.9
CLK1-208	ENST00000464454	DECR1	Q16698	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MCU	Q8NE86	351 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DACH2	Q96NX9	599 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	APOL6	Q9BWW8	343 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PR77	199 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ADAMDEC1	O15204	470 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	KCNN4	O15554	427 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	ADAM20	O43506	726 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	PMS2P2	O95744	297 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	UGT1A1	P22309	533 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	SUOX	P51687	545 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	CLCNKA	P51800	687 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	COASY	Q13057	564 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	DLG2	Q15700	870 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CLK1-208	ENST00000464454	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.06	□□□□□ -1.76

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