RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-203ENST00000463369 CDKL2Q92772 493 aa8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 C1orf74Q96LT6 269 aa8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 MTMR10Q9NXD2 777 aa8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CD300AQ9UGN4 299 aa8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 SARDHQ9UL12 918 aa8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 CDYLQ9Y232 598 aa8.65□□□□□ -1.02
SHQ1-203ENST00000463369 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
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SHQ1-203ENST00000463369 CLIC3O95833 236 aa8.65□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 SNX31Q8N9S9 440 aa8.65□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 TRPV4Q9HBA0 871 aa8.65□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 MAGEE1Q9HCI5 957 aa8.65□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.65□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 HACD3Q9P035 362 aa8.65□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 KLK14Q9P0G3 267 aa8.65□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 KLQ9UEF7 1012 aa8.65□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 TBX21Q9UL17 535 aa8.65□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 USP18Q9UMW8 372 aa8.65□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 NRP1O14786 923 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 KMOO15229 486 aa8.64□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 SFTPCP11686 197 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 CKMT1AP12532 417 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 STMN1P16949 149 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 HOXC12P31275 282 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 GRIA1P42261 906 aa8.64□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.64□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.64□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 WDR49Q8IV35 697 aa8.64□□□□□ -1.03
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SHQ1-203ENST00000463369 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 S100ZQ8WXG8 99 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 NRBF2Q96F24 287 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 FBXL20Q96IG2 436 aa8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-203ENST00000463369 FAR2Q96K12 515 aa8.64□□□□□ -1.03
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