RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.33■□□□□ 0.85
IMP4-209ENST00000462357 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.33■□□□□ 0.85
IMP4-209ENST00000462357 H7C0S8 307 aa20.33■□□□□ 0.85
IMP4-209ENST00000462357 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
IMP4-209ENST00000462357 UGT1A9O60656 530 aa20.33■□□□□ 0.85
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IMP4-209ENST00000462357 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
IMP4-209ENST00000462357 UGT1A6P19224 532 aa20.33■□□□□ 0.85
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IMP4-209ENST00000462357 UGT1A1P22309 533 aa20.33■□□□□ 0.85
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IMP4-209ENST00000462357 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
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IMP4-209ENST00000462357 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.32■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 ZNF449Q6P9G9 518 aa20.32■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 PCGF5Q86SE9 256 aa20.32■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 COPS8Q99627 209 aa20.32■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 MAGEB16A2A368 324 aa20.31■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 MC4RP32245 332 aa20.31■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.31■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 AMZ2Q86W34 360 aa20.31■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 KIR2DS3K7RE56 304 aa20.3■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
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IMP4-209ENST00000462357 KCTD16Q68DU8 428 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CERS6Q6ZMG9 384 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PRUNE1Q86TP1 453 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
IMP4-209ENST00000462357 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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