RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 BIRC2Q13490 618 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 OLIG2Q13516 323 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 RANBP10Q6VN20 620 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CRELD1Q96HD1 420 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 RDH14Q9HBH5 336 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ATMQ13315 3056 aa23.39■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PLD2O14939 933 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 BUD23O43709 281 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TNFSF15O95150 251 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CPNE6O95741 557 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CD1CP29017 333 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 MAP9Q49MG5 647 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CRTC3Q6UUV7 619 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 RAB11FIP2Q7L804 512 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TTC13Q8NBP0 860 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF248Q8NDW4 579 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 DTX3LQ8TDB6 740 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 APOL2Q9BQE5 337 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 NUDT22Q9BRQ3 303 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TSGA10Q9BZW7 698 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ITGA2BP08514 1039 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 HGFP14210 728 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A5P35504 534 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SPAM1P38567 509 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 IYDQ6PHW0 289 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 USP53Q70EK8 1073 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PDZD3Q86UT5 571 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO39Q8N4B4 442 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA6CQ9H3T2 930 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SLC23A2Q9UGH3 650 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 GUCA1BQ9UMX6 200 aa23.38■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KALRNO60229 2985 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 C5orf60A6NFR6 353 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGAP6O43182 974 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZW10O43264 779 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 VEGFDO43915 354 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PRPSAP1Q14558 356 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CHRNA6Q15825 494 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 NKAIN2Q5VXU1 208 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 FAM151BQ6UXP7 276 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CLEC14AQ86T13 490 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PIM3Q86V86 326 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF547Q8IVP9 402 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SPACA3Q8IXA5 215 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KLC4Q9NSK0 619 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PKP3Q9Y446 797 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ARL5AQ9Y689 179 aa23.37■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 GPR39O43194 453 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KRT86O43790 486 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SNX2O60749 519 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PPFIA2O75334 1257 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CDK14O94921 469 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 F3P13726 295 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CLCNKAP51800 687 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TLE3Q04726 772 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PTPRCAPQ14761 206 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PHF19Q5T6S3 580 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 LRRTM4Q86VH4 590 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SLC35B2Q8TB61 432 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PRDM8Q9NQV8 689 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KCNK4Q9NYG8 393 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 LOXL2Q9Y4K0 774 aa23.36■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PRR19A6NJB7 356 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 KMOO15229 486 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A9O60656 530 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A6P19224 532 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A1P22309 533 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A4P22310 534 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CA5AP35218 305 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A3P35503 534 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 GDAP1Q8TB36 358 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 TIMM29Q9BSF4 260 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXB3-202ENST00000460160 UGT1A7Q9HAW7 530 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms