RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF18P17022 549 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PTMSP20962 102 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PON1P27169 355 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GABRR2P28476 465 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOXD12P35452 270 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 USP8P40818 1118 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TUFMP49411 452 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K7CLP57077 242 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CETN1Q12798 172 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VEPH1Q14D04 833 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACOX1Q15067 660 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EXOC3L4Q17RC7 722 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF385BQ569K4 471 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM270Q6UE05 265 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPATA18Q8TC71 538 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TFAP2BQ92481 460 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSMG2Q969U7 264 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC37BQ96QE4 947 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYO10Q9HD67 2058 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCANO14594 1321 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TULP2O00295 520 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EPHB6O15197 1021 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P4HA2O15460 535 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NARSO43776 548 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DOK2O60496 412 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCGB1D1O95968 90 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LAMP2P13473 410 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ALOX12P18054 663 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ANXA13P27216 316 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CD6P30203 668 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PGFP49763 221 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NHLH2Q02577 135 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P3H1Q32P28 736 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TXNDC8Q6A555 127 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PARM1Q6UWI2 310 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.63□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q8NA96 180 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBA3Q8TBC4 463 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FGF14Q92915 247 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDCL3Q9H2J4 239 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDH7Q9ULB5 785 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAFFQ9ULX9 164 aa8.63□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYH10P35580 1976 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1W2PS29 197 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC78A2IDD5 438 aa8.62□□□□□ -1.03
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRIAP1O43715 76 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PLOD3O60568 738 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRAMEF10O60809 474 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NOL4O94818 638 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GPANK1O95872 356 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM200BP0CF97 657 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAGEA11P43364 429 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSTM5P46439 218 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIRAPP58753 221 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP2CBP62714 309 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP2CAP67775 309 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD11B2P80365 405 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBXN1Q04323 297 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMARCB1Q12824 385 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DYRK1AQ13627 763 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYCP1Q15431 976 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM196Q5HYL7 178 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC20AQ6ZU45 233 aa8.62□□□□□ -1.03
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