RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439048.1

MMS19-210, Transcript of MMS19 homolog, cytosolic iron-sulfur assembly component, humanhuman

TSL 5

Gene MMS19, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19-210ENST00000439048 A0A1W2PQM1 296 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CHUKO15111 745 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 KMOO15229 486 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 GPR39O43194 453 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CEP104O60308 925 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 BRINP1O60477 761 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CDK14O94921 469 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 AP2A1O95782 977 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 FGGP02679 453 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SLC2A4P14672 509 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 GABREP78334 506 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 PTPRCAPQ14761 206 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 DDHD1Q8NEL9 900 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SLC37A2Q8TED4 501 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SMOXQ9NWM0 555 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TBC1D29Q9UFV1 150 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 FKBPLQ9UIM3 349 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa18.08■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CACNA1BQ00975 2339 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 E7EVH7 732 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TAF4O00268 1085 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A9O60656 530 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SNX2O60749 519 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 MPOP05164 745 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A6P19224 532 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A1P22309 533 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A4P22310 534 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 AKT1P31749 480 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CXCR5P32302 372 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A3P35503 534 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A5P35504 534 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 FDFT1P37268 417 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 LMAN1P49257 510 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 PDX1P52945 283 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SEPT6Q14141 434 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CCNG2Q16589 344 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 MAP9Q49MG5 647 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 C3orf38Q5JPI3 329 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 LINC00523Q86TU6 105 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SFRP1Q8N474 314 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 OR13C4Q8NGS5 318 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TIMM29Q9BSF4 260 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A7Q9HAW7 530 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A10Q9HAW8 530 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 UGT1A8Q9HAW9 530 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 EPB41L5Q9HCM4 733 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 KLC4Q9NSK0 619 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 RAXQ9Y2V3 346 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 KCTD3Q9Y597 815 aa18.07■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 APC2O95996 2303 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ZSCAN12O43309 604 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SRP72O76094 671 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 EML2O95834 649 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 VCLP18206 1134 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ALDH4A1P30038 563 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 HADHAP40939 763 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 GPR3P46089 330 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CLCNKAP51800 687 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 INHBCP55103 352 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 OR1D5P58170 312 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 B4GALNT1Q00973 533 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 NR1D2Q14995 579 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 LONRF2Q1L5Z9 754 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 AMZ1Q400G9 498 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ZNF398Q8TD17 642 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TMEM74Q96NL1 305 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 STRADBQ9C0K7 418 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ZMYND15Q9H091 742 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 KCNF1Q9H3M0 494 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 PAK5Q9P286 719 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 SATB2Q9UPW6 733 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 JRKLQ9Y4A0 524 aa18.06■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 CCDC187A0A096LP49 1063 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 A6NCN8 305 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 GAS8O95995 478 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 F3P13726 295 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TPH1P17752 444 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 MSH3P20585 1137 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 ITGALP20701 1170 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 FASLGP48023 281 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 LSSP48449 732 aa18.05■□□□□ 0.48
MMS19-210ENST00000439048 TMPRSS15P98073 1019 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms