RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 CATSPER2Q96P56 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ACBD6Q9BR61 282 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SLC26A6Q9BXS9 759 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CIPCQ9C0C6 399 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PS29 197 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 EFCAB7A8K855 629 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 LACTBL1A8MY62 500 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PPEF2O14830 753 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PROM1O43490 865 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ATP8B1O43520 1251 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TIMM44O43615 452 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 STX10O60499 249 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 HUS1O60921 280 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TOM1L1O75674 476 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TCEA3O75764 348 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SMC2O95347 1197 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV4-34P06331 123 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TPM1P09493 284 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF18P17022 549 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DDCP20711 480 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TGM2P21980 687 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PEX3P56589 373 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF234Q14588 700 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 STAT4Q14765 748 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA1Q5VX52 437 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CREBRFQ8IUR6 639 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A45Q8N413 288 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SPC24Q8NBT2 197 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DDB2Q92466 427 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TFAP2BQ92481 460 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 SPATA17Q96L03 361 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 APOLD1Q96LR9 279 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CEP295NLQ96MC4 621 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GSDMAQ96QA5 445 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM245Q9H330 911 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 POLD4Q9HCU8 107 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 F8P00451 2351 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 OBSL1O75147 1896 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PR77 199 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TTC26A0AVF1 554 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KPNA7A9QM74 516 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 PIRO00625 290 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 MPPED1O15442 326 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN12O43309 604 aa6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 OLFM2O95897 454 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 OAS1P00973 400 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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PTPRK-211ENST00000429595 RNF224P0DH78 156 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DGKAP23743 735 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GATA3P23771 443 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEA11P43364 429 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 GALCP54803 685 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 RPS14P62263 151 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 OVGP1Q12889 678 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TAF10Q12962 218 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 DPCR1Q3MIW9 517 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 HECTD3Q5T447 861 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 KAZNQ674X7 775 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRK-211ENST00000429595 VSTM1Q6UX27 236 aa6.34□□□□□ -1.39
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