RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EFCAB14O75071 495 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF1O95521 474 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMP1P01033 207 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAX7P23759 505 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GKP32189 559 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD70P32970 193 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPK8P45983 427 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CSNK1DP48730 415 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRB7Q14451 532 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIP10Q15642 601 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF19Q2TAC6 998 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDSS2Q86YH6 399 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPSM1Q86YR5 675 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PQLC1Q8N2U9 271 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLG2Q9UHN1 485 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMCO1Q9UM00 188 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa18.54■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1W2PRU2 124 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOCS5O75159 536 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00032P0C843 101 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACRP10323 421 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJA1P17302 382 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC26Q2I0M4 334 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEKHG6Q3KR16 790 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIBINQ8TAL6 211 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUBGCP3Q96CW5 907 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TNKS2Q9H2K2 1166 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABCB8Q9NUT2 735 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DHRS7Q9Y394 339 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX2O60749 519 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRCPO75575 148 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MLYCDO95822 493 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8AP07357 584 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINGO3P0C6S8 592 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ECT2LQ008S8 904 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGFBIQ15582 683 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LILRA6Q6PI73 481 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HACD2Q6Y1H2 254 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SYVN1Q86TM6 617 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINA9Q86WD7 417 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FIBCD1Q8N539 461 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLG3Q92796 817 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB9Q96DX5 294 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPDL1Q96EA4 605 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD274Q9NZQ7 290 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF225Q9UK10 706 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMM22Q9Y584 194 aa18.53■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPPA5A6NC42 116 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ESRRBO95718 433 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGSF6O95976 241 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LBPP18428 481 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HNF1BP35680 557 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKN3Q16667 212 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSTA3Q16772 222 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFT2D3Q587I9 215 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM154Q6P9G4 183 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAF1Q8N7H5 531 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ESAMQ96AP7 390 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf43Q9BQ61 176 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HGH1Q9BTY7 390 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPAG4Q9NPE6 437 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB1Q9Y576 335 aa18.52■□□□□ 0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN8A6NHC0 703 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GOLGA8CPA6NN73 597 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LEFTY2O00292 366 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 E2F3O00716 465 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM24O15164 1050 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS4BO75351 444 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN7O95471 211 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HGFP14210 728 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CA5AP35218 305 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFATC2Q13469 925 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.51■□□□□ 0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC149Q6ZUS6 474 aa18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms