RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TBL1YQ9BQ87 522 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GIN1Q9NXP7 522 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MID2Q9UJV3 735 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 XIRP2A4UGR9 3374 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AQP9O43315 295 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 JAK1P23458 1154 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINB6P35237 376 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HALP42357 657 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CLCN7P51798 805 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IFITM2Q01629 132 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL22Q6P050 247 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF773Q6PK81 442 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ITIH5Q86UX2 942 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DHFR2Q86XF0 187 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CPA6Q8N4T0 437 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP3.6□□□□□ -1.834e-9■■■■■ 47.1
PGGT1B-203ENST00000419445 TBATAQ96M53 351 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ELP3Q9H9T3 547 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 F5P12259 2224 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 UBXN8O00124 270 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM1O15116 133 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAP91O60641 907 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GPC4O75487 556 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 BAIAP3O94812 1187 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GALT4O96024 378 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 JUNDP17535 347 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ITIH1P19827 911 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FGFR3P22607 806 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TGFBR2P37173 567 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NAA20P61599 178 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CATSPEREQ5SY80 951 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM26Q6ZUK4 368 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNYQ8ND76 341 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 APPL2Q8NEU8 664 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 VWCEQ96DN2 955 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CROTQ9UKG9 612 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDYLQ9Y232 598 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51B4Q9Y5P0 310 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0J9YYE9 177 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AZIN1O14977 448 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 YAP1P46937 504 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CSHL1Q14406 222 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM83EQ2M2I3 478 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 EML3Q32P44 896 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 INAVAQ3KP66 663 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00523Q86TU6 105 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFAND4Q86XD8 727 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SFRP1Q8N474 314 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAR1Q8WVX9 515 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FAR2Q96K12 515 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SIRT5Q9NXA8 310 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GJA3Q9Y6H8 435 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC34A8MYJ7 566 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 J3QRK9 145 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC7O00311 574 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KERAO60938 352 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CD4P01730 458 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRNA1P02708 482 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DCTP40126 519 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SCNN1GP51170 649 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 IGBP1P78318 339 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MPPE1Q53F39 396 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SPPL2CQ8IUH8 684 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHAC2Q8WUX2 184 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MUL1Q969V5 352 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL8Q96CD0 374 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 GAD1Q99259 594 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 CHID1Q9BWS9 393 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 MPP6Q9NZW5 540 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 NOP56O00567 594 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 KLKB1P03952 638 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 DSC2Q02487 901 aa3.6□□□□□ -1.83
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENBP1Q13228 472 aa3.6□□□□□ -1.83
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